Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC115618.3-201ENST00000623114 425 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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KRTAP21-3Q3LHN1 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 VKORC1-203ENST00000354895 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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