Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms