Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL67

PARP6, Poly [ADP-ribose] polymerase 6, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP6Q2NL67 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PARP6Q2NL67 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms