Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM187BQ17R55 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms