Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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