Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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CTF1Q16619 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
CTF1Q16619 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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CTF1Q16619 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
CTF1Q16619 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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