Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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SSX1Q16384 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SSX1Q16384 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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