Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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NEDD8Q15843 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
NEDD8Q15843 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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