Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CCDC85BQ15834 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CCDC85BQ15834 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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