Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TWIST1Q15672 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms