Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRKQ15262 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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