Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GTF2H3Q13889 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.8 ms