Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CUL4AQ13619 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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