Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PEX6Q13608 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PEX6Q13608 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms