Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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NAE1Q13564 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NAE1Q13564 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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