Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PPP1R1AQ13522 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PPP1R1AQ13522 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms