Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TUBB3Q13509 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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