Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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FOXE3Q13461 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FOXE3Q13461 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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