Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SGCGQ13326 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCGQ13326 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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