Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SKP2Q13309 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.7 ms