Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLN3Q13286 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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