Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CSTF3Q12996 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CSTF3Q12996 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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