Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SCAPQ12770 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCAPQ12770 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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