Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PDE4BQ07343 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PDE4BQ07343 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms