Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FMODQ06828 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms