Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD51Q06609 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms