Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC126474.1-201ENST00000623555 1293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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TNP2Q05952 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
TNP2Q05952 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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