Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM193AP78312 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM193AP78312 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms