Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms