Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP6V0D1P61421 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms