Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ACTBP60709 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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