Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLC12A2P55011 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms