Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMP3P54852 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMP3P54852 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms