Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PGGT1BP53609 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PGGT1BP53609 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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