Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLCSP50747 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLCSP50747 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HLCSP50747 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms