Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RGS4P49798 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms