Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDK8P49336 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDK8P49336 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDK8P49336 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms