Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRPC1P48995 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms