Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ETV4P43268 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ETV4P43268 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV4P43268 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ETV4P43268 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ETV4P43268 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms