Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIM23P36406 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM23P36406 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms