Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HLA-DMAP28067 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms