Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
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