Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms