Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYT1P21579 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms