Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ATP4AP20648 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms