Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRHP20396 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRHP20396 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRHP20396 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRHP20396 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms