Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SLC9A1P19634 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms