Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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PTPRAP18433 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPRAP18433 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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