Protein–RNA interactions for Protein: P13861

PRKAR2A, cAMP-dependent protein kinase type II-alpha regulatory subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2AP13861 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PRKAR2AP13861 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PRKAR2AP13861 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms