Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHGAP10645 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHGAP10645 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHGAP10645 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHGAP10645 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms